慢性結腸炎若不及時治療可能引發(fā)腸梗阻、營養(yǎng)不良和癌變風險增加。長期炎癥刺激會導致腸道功能紊亂和結構損傷，危害程度隨病程延長逐漸加重。

腸道黏膜持續(xù)充血水腫可能發(fā)展為腸腔狹窄。炎癥反復發(fā)作形成瘢痕組織，使腸壁彈性下降，部分患者會出現(xiàn)不完全性腸梗阻，表現(xiàn)為腹脹、排便困難。急性發(fā)作期可能進展為完全性腸梗阻，需急診手術解除阻塞。

長期腹瀉影響營養(yǎng)吸收可能導致貧血和消瘦。炎癥腸段吸收功能受損，蛋白質(zhì)、維生素B12等營養(yǎng)素吸收障礙，部分患者出現(xiàn)低蛋白血癥。兒童患者可能伴隨生長發(fā)育遲緩，成年患者易發(fā)生骨質(zhì)疏松。

持續(xù)10年以上的病變可能增加結直腸癌風險。炎癥反復修復過程中上皮細胞異常增生，尤其是全結腸型病變患者癌變率達正常人群的10-15倍。定期腸鏡監(jiān)測能早期發(fā)現(xiàn)不典型增生病變。

病程超過8年的患者可能出現(xiàn)中毒性巨結腸等嚴重并發(fā)癥。腸壁神經(jīng)節(jié)細胞受損導致腸管擴張，伴隨發(fā)熱、心動過速等全身中毒癥狀，需緊急醫(yī)療干預。少數(shù)患者會繼發(fā)腸穿孔或膿毒血癥。

病變活動期可能誘發(fā)關節(jié)疼痛和皮膚損害等腸外表現(xiàn)。約20%患者出現(xiàn)外周關節(jié)炎，5%發(fā)生結節(jié)性紅斑。這些癥狀與免疫復合物沉積有關，在腸道炎癥控制后多能自行緩解。