軟下疳不經(jīng)治療的自然病程可持續(xù)數(shù)月，小的病損可在2-4周內(nèi)愈合。由于出現(xiàn)了對磺胺和四環(huán)素，氯霉毒等耐藥菌株，使軟下疳的治療有些困難。
一、全身治療：
(1)紅霉素，利君沙，羅紅霉素，阿齊霉素;
(2)(2)頭孢曲松鈉，治菌必妥，樂施福定，特滅菌;
二、局部治療：
(1)未破潰的丘疹或結(jié)節(jié)，外用魚石脂，紅霉素軟膏。
(2)潰瘍，用1/5000高錳酸鉀或雙氧水沖洗，然后，外用紅霉素軟膏，因軟下疳易于自身接種，應(yīng)做好局部清潔消毒。
(3)膿腫;穿刺應(yīng)在遠(yuǎn)處正常皮膚刺入膿腔，抽吸膿液。
三、合并HIV感染的處理
這類患者有潰瘍愈合更慢，療程要更長，短程治療往往失敗，應(yīng)用兩種以上抗生素聯(lián)合用藥。有條件時(shí)應(yīng)從病灶中分離杜克雷嗜血桿菌作抗生素敏感試驗(yàn)。
治療3-7天后，應(yīng)對患者進(jìn)行再次檢查，若治療有效，3日內(nèi)潰瘍癥狀即有改善，7日內(nèi)潰瘍即可見明顯愈合。否則，應(yīng)考慮：診斷是否正確，是否同時(shí)合并另一種STDs病原體感染;是否同時(shí)有HIV感染;或杜克雷嗜血桿菌是否對抗生素耐藥。通常，潰瘍愈合的時(shí)間和潰瘍大小有關(guān)，較大的潰瘍可能需要兩周才能愈合。
